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5383次萊氏無膽甾原體PCR 檢測試劑盒說明書
1、 試劑盒簡介
流行性造血器官壞死病,是由無囊膜胞漿型虹彩病毒科蛙病毒屬的流行性造血器官壞死病毒
(EHNV)所引起的魚類疾病。病魚因肝臟、脾臟、腎臟造血組織和其他組織壞死而導致死亡。易感動物主要為赤鱸、虹鱒等種類,其中,赤鱸對該病毒極為敏感,幼魚和成魚都可受 EHNV 感染。EHNV 屬于虹彩病毒科蛙病毒屬(除新加坡石斑魚虹彩病毒之外)病毒,本公司針對蛙病毒屬的流行性造血器官壞死病毒( epizootic haematopoietic necrosis virus, EHNV)等病毒的主衣殼蛋白( MCP) 基因序列,開發(fā)生產(chǎn)了本試劑盒。應用本試劑盒進行檢測具有快速、靈敏、特異、準確 、安全、操作簡單、應用廣泛等特點及優(yōu)點。
2、萊氏無膽甾原體PCR 檢測試劑盒 試劑盒組成
試劑盒組成包括*和核酸擴增試劑,具體組成參見表 1:
表 1:試劑盒組成(50test/盒)
試劑盒組成成分 體積
*: 樣品 DNA 提取液 1
樣品 DNA 提取液 2 5ml×1 管
500µl×1 管
核酸擴增試劑: DEPC 水
EHNV 熒光 PCR 反應液
Taq 酶(5U/ul) 陰性對照
EHNV 熒光陽性對照 5ml×1 管
750µl×1 管
40µl×1 管
1ml×1 管
1ml×1 管
*保存條件:樣品 DNA 提取液 1、2 和試劑盒須在-20℃保存。
3、 樣本采集,存放及運輸
樣本采集
采集活的或瀕死的魚的腎或脾等組織,研磨PBS稀釋后提取核酸?;驅⒓毎囵B(yǎng)分離病毒的有CPE 的細胞懸液提取核酸病毒。
存放
研磨后的樣本在 2 ℃—8 ℃條件下保存應不超過 24 h;-70 ℃以下可*保存,但應避免反復凍融(多凍融 3 次)。
運輸
采用冰或泡沫箱加冰密封進行運輸。
4、 萊氏無膽甾原體PCR 檢測試劑盒 檢測步驟
DNA 核酸提取操作方法(在樣本處理區(qū)進行):
取 n 個 1.5ml 滅菌 Eppendorf 管,其中 n 為待檢樣品數(shù)、一管陽性對照和一管陰性對照之和, 對每個管進行編號標記。
每管加入 100 µl DNA 提取液 1,然后分別加入待測樣本、陰性對照和陽性對照(陽性對照吸取前充分混勻)各 100µl,一份樣本換用一個吸頭;混勻器上震蕩混勻 5 s,于 4℃~25℃條件下, 12 000 r/min 離心 10 min。
盡可能吸棄上清且不碰沉淀,再加入 10µl DNA 提取液 2,混勻器上震蕩混勻 5s,于 4℃~25℃ 條件下,2 000 r/min 離心 10 s。
100℃ 干浴或沸水浴 10 min;加入 90µl DEPC 水,12 000 r/min 離心 10 min,吸取上清, 即為提取的 DNA,冰上保存待用(提取的 DNA 需在 2 h 內(nèi)進行 PCR 擴增或放置于-70℃冰箱內(nèi)保存)。
熒光 PCR 檢測
擴增試劑準備(在反應混合物配制區(qū)進行):
從試劑盒中取出熒光 PCR 反應液、Taq 酶,2000×g 離心 5 秒鐘。每個樣品測試反應體系配制見下表 2。
表 2 每個樣品測試反應體系配制表
試劑 熒光 PCR 反應液 Taq 酶 合計
用量 14.5 μL 0.5μL 15μL
加樣(樣本處理區(qū)進行):
向每個PCR 管中各分裝15μL 的混合液,再分別加入樣本DNA 模板10μL,蓋緊管蓋,500 r/min
離心 30 s。
熒光 PCR 檢測(在檢測區(qū)進行): 循環(huán)條件設置:
一階段,94 oC /4 min;
萊氏無膽甾原體PCR 檢測試劑盒 第二階段,95oC/15 s,60 oC/60 s; 40個循環(huán);在每次循環(huán)的60 oC退火延伸時收集熒光。試驗檢測結束后,根據(jù)收集的熒光曲線和Ct值判定結果。
5、 結果判定
結果分析條件設定
直接讀取檢測結果。閾值設定原則根據(jù)儀器噪聲情況進行調(diào)整,以閾值線剛好超過正常陰性樣品擴增曲線的點為準。
質(zhì)控標準
5.2.1陰性對照無Ct值或無擴增曲線。
5.2.2陽性對照的Ct值應<28.0,并出現(xiàn)典型的擴增曲線。否則,此次實驗視為無效。
結果描述及判定
5.3.1陰性
無Ct值或無擴增曲線,示樣品中無EHNV核酸。
5.3.2陽性
Ct值≤30,且出現(xiàn)典型的擴增曲線,示樣品中存在EHNV核酸。為進一步確診是EHNV,建議用普通PCR進行確認或測序。
5.4 有效原則
Ct>30的樣本建議重做。重做結果無數(shù)值者為陰性,否則為陽性。
6、 相關技術信息
MCP-153F: 5’-TCACCAAGCTGCCGTCTCT-3’ MCP-215R:5’-AAAACTGCTGCCCGAAAGC-3’
MCP-175T: (FAM)5’-CGCCAAGATGTCGGGCAACCC-3’(TAMR
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