由于細(xì)胞的高度透明性,觀察其中的細(xì)胞器十分困難。通過熒光染色,生物學(xué)家可以標(biāo)記特定的細(xì)胞器對其進(jìn)行觀察。絕大部分熒光分子在吸收或發(fā)射過程中,表現(xiàn)為有方向的偶極子。通過熒光偏振顯微鏡測量偶極子特性,能夠反映靶分子的取向特性,從而為研究靶分子的空間構(gòu)象和運(yùn)動特性提供重要信息。
為了打破傳統(tǒng)熒光偏振顯微鏡受光學(xué)衍射限制的問題,諸多超分辨熒光偏振顯微鏡技術(shù)被提出,如單分子定向定位顯微鏡(SMOLM)和偏振調(diào)制技術(shù)(SDOM、SPoD等)。然而,SMOLM在追求高空間分辨率的同時(shí)犧牲了時(shí)間分辨率,使得快速生物成像成為一項(xiàng)艱巨的挑戰(zhàn)。SDOM等偏振調(diào)制技術(shù)雖具有較高的時(shí)空分辨率,但只能求解偶極子的二維取向,缺乏解析偶極子三維取向的能力。三維取向能夠提供熒光分子更全面的三維空間結(jié)構(gòu),因此,關(guān)鍵問題是如何打破時(shí)空分辨率和取向維度之間的權(quán)衡,實(shí)現(xiàn)超過衍射極限分辨率的同時(shí),能夠快速成像和解析偶極子的三維方向。
針對偶極子取向解析問題,北京大學(xué)未來技術(shù)學(xué)院席鵬教授團(tuán)隊(duì)繼2016年提出二維偶極子取向映射方法SDOM(Light.: Sci. Appl., 2016),及2022年基于光學(xué)鎖相探測的二維取向映射方法OLID-SDOM(Light.: Sci. Appl., 2022)后,為打破時(shí)空分辨率和三維取向維度的權(quán)衡瓶頸,開發(fā)了新型的三維取向映射顯微鏡(3DOM)。相關(guān)研究成果以“Three-dimensional dipole orientation mapping with high temporal-spatial resolution”為題,于2024年4月16日在線發(fā)表在PhotoniX期刊。
3DOM方法基于團(tuán)隊(duì)開發(fā)的偏振結(jié)構(gòu)光超分辨顯微技術(shù),把楊氏雙縫干涉的原理反過來,結(jié)合光路可逆的原理,利用不同角度的條紋產(chǎn)生不同方向的正負(fù)一級光束。進(jìn)一步,只需要把相應(yīng)的負(fù)一級次光擋住,就可以產(chǎn)生單一方向的傾斜照明。把這一傾斜投影到z軸不同的角度,利用FISTA算法對圖像進(jìn)行重建,在倒易空間結(jié)合偏振調(diào)制系數(shù)和重建結(jié)果,即可實(shí)現(xiàn)高精度的偶極子取向解析。
圖1 三維取向映射顯微鏡原理圖
圖2 SYTOX Orange標(biāo)記λ-DNA的3DOM成像結(jié)果
研究結(jié)果表明,3DOM方法有效地克服了偏振
熒光顯微鏡在使用寬場成像進(jìn)行高時(shí)空分辨率和三維方向映射方面的局限性,提供了更全面的熒光團(tuán)分子的三維空間結(jié)構(gòu)。這不僅能夠應(yīng)用于區(qū)分DNA、膜細(xì)胞器以及各種細(xì)胞骨架組織的宏觀形態(tài)(肌動蛋白絲和微管),而且還可以獲得結(jié)構(gòu)的有序性和結(jié)合緊密度等有價(jià)值的信息。此外,3DOM的主要優(yōu)點(diǎn)之一是它易于在現(xiàn)有的寬場系統(tǒng)中升級,適用范圍廣,這增強(qiáng)了其在不同研究環(huán)境中的可及性和可用性??梢灶A(yù)見未來3DOM這個(gè)強(qiáng)大的工具將會有助于研究人員解析復(fù)雜的細(xì)胞器結(jié)構(gòu),推動對眾多生物結(jié)構(gòu)和納米級相互作用的理解,為結(jié)構(gòu)生物學(xué)家、生物動力學(xué)家?guī)硇碌挠^察工具。
席鵬和生命科學(xué)學(xué)院李美琪老師為本文的共同通訊作者。北京大學(xué)未來技術(shù)學(xué)院博士生鐘素藝為該項(xiàng)成果的第一作者。該研究得到了科技部國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的支持。
席鵬課題組致力于發(fā)展新型超分辨顯微成像技術(shù),在偏振超分辨方面開展了如下工作:(1)利用偏振偶極子解析實(shí)現(xiàn)了50nm的超分辨與熒光二維偶極子測量(Light: Science and Applications 2016 ); (2)通過解析結(jié)構(gòu)光超分辨中的偏振信息,實(shí)現(xiàn)了偏振SIM超分辨(Nature Communications 2019),并成功實(shí)現(xiàn)商業(yè)化;(3)結(jié)合熒光分子的
化學(xué)極性(
光譜紅移)與物理序性(偶極子自由度)信息,成功實(shí)現(xiàn)了10種細(xì)胞器的同時(shí)觀察與環(huán)境研究(Nature Communications 2020);(4)通過偏振調(diào)制和光學(xué)鎖定放大技術(shù)來增強(qiáng)微弱的偏振調(diào)制信號,實(shí)現(xiàn)活細(xì)胞中亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的熒光各向異性的高靈敏度測量(Light: Science and Applications 2022);(5)發(fā)展了具有偶極子方位解析能力的3D-SIM開源軟件Open-3DSIM(Nature Methods 2023 )和開源硬件(Advanced Photonics Nexus 2024);(6)對相關(guān)的SIM重建算法進(jìn)行了系統(tǒng)綜述(Light: Science and Applications 2023) 。
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