NIST RM8398(QTY10)全基因組變異評估標(biāo)準(zhǔn)品旨在用于驗證、優(yōu)化和過程評估目的。它由猶他州/歐洲血統(tǒng)的女性全.人類基因組樣本組成,可用于評估基因組測序中變異調(diào)用的性能。
該材料旨在通過獲得真陽性、假陽性和假陰性的估計值來評估人類基因組測序變異檢出的性能。測序應(yīng)用可能包括全基因組測序、全外顯子組測序和更有針對性的測序,例如基因組。這種基因組 DNA 的分析方式與實驗室處理和分析提取的 DNA 的任何其他樣本相同。由于 RM 是提取的 DNA,因此它對于評估 DNA 提取等分析前步驟沒有用處,但它確實挑戰(zhàn)了測序文庫的制備、測序機(jī)器以及作圖、比對和變異調(diào)用的生物信息學(xué)步驟。此 RM 并非旨在評估后續(xù)的生物信息學(xué)步驟,例如功能或臨床解釋。
NIST RM8398(QTY10)全基因組變異評估標(biāo)準(zhǔn)品由一個裝有人類基因組 DNA 的小瓶組成,該基因組 DNA 是從單個大生長的人類淋巴母細(xì)胞系 GM12878(標(biāo)記為 HG-001)中提取的。科里爾醫(yī)學(xué)研究所(新澤西州卡姆登)。該小瓶含有大約 10 µg 基因組 DNA,DNA 位于 TE 緩沖液(10 mM TRIS,1 mM EDTA,pH 8.0)中。
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