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島津MALDI-TOF微生物鑒定系統(tǒng)探索地下水質(zhì)量和菌群之間的聯(lián)系
地下水中的細(xì)菌群落非常重要，因?yàn)樗鼈儽３至似胶獾纳锏厍蚧瘜W(xué)環(huán)境。研究當(dāng)遭受壓力環(huán)境(例如，由于人為污染)時(shí)，細(xì)菌群落及其動(dòng)態(tài)變化。通過(guò)面對(duì)環(huán)境變化的地下水微生物組的反應(yīng)，可以增加我們對(duì)微生物生態(tài)學(xué)不斷增長(zhǎng)的了解，并將其用于新型生物修復(fù)策略的發(fā)展。
采用高通量且更簡(jiǎn)單的技術(shù)來(lái)實(shí)時(shí)研究不同的微生物群落及其動(dòng)力學(xué)是必要的，尤其是在檢查較大的數(shù)據(jù)集時(shí)。MALDI-TOF是用于高通量鑒定細(xì)菌的主要工具。美國(guó)德克薩斯大學(xué)阿靈頓分?；瘜W(xué)與生物化學(xué)系、環(huán)境分析與修復(fù)合作實(shí)驗(yàn)室附屬機(jī)構(gòu)，以及圣安東尼奧市和休斯敦UTHealth公共衛(wèi)生學(xué)院基于島津微生物鑒定平臺(tái)iDplus Cofidence共同研究探索了油氣開(kāi)采活動(dòng)與附近地下水細(xì)菌群落之間的聯(lián)系。
MALDI-TOF鑒定受污染地下水中的細(xì)菌種類(lèi)
從德克薩斯州弗里奧縣Eagle Ford頁(yè)巖地區(qū)的水樣中發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌種類(lèi)的總菌落形成單位(CFU)。并顯示了附近活動(dòng)的常規(guī)生產(chǎn)井(綠點(diǎn))和非常規(guī)生產(chǎn)井(紫色點(diǎn))的位置。
熱圖：顯示德克薩斯州弗里奧縣的19個(gè)地下水樣品中的不同細(xì)菌種類(lèi)。熱圖上的數(shù)字表示CFU。
在這項(xiàng)工作中，從德克薩斯州南部地區(qū)收集了地下水樣品，其中農(nóng)業(yè)活動(dòng)和非常規(guī)油氣開(kāi)發(fā)是普遍的人為活動(dòng)。使用MALDI-TOF MS對(duì)細(xì)菌群落進(jìn)行了評(píng)估，并根據(jù)多種有機(jī)和無(wú)機(jī)地下水成分對(duì)細(xì)菌的多樣性和豐度進(jìn)行了分析，主要分離了Phylum變形桿菌的反硝化細(xì)菌和異養(yǎng)細(xì)菌，這些微生物能夠?qū)⑾跛猁}轉(zhuǎn)化為氣態(tài)形式的氮或降解有機(jī)化合物，例如碳?xì)浠衔?。總體而言，從所收集的地下水樣品中觀察到的組成差異，細(xì)菌群落差異很大。這些數(shù)據(jù)為位于人為地表和地下活動(dòng)附近的地下水中細(xì)菌多樣性提供了基線(xiàn)測(cè)量。
參考文獻(xiàn)：
Science of the Total Environment 618 (2018) 165–173
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