美國國家生物標(biāo)準(zhǔn)與控制研究所(NIBSC)的最新研究證實(shí),在廢水樣品中發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒Δ亞型AY.4.2的頻率越來越高。
自大流行爆發(fā)以來,NIBSC研究所的科學(xué)家一直在分析倫敦一家污水處理廠的樣本,并且先前已經(jīng)表明,環(huán)境監(jiān)測可用于測量病毒傳播水平并主動識別令人擔(dān)憂的新變體。
NIBSC通過大流行觀察到廢水樣本中變異優(yōu)勢的轉(zhuǎn)變,密切反映了臨床樣本的測序結(jié)果。2020年3月至4月,在廢水樣本中第一次觀察到變種D614在大流行的頭幾個月內(nèi)取代了全球原來的武漢毒株。.2020年11月10日,在樣本中第一次發(fā)現(xiàn)了一種新的更具傳染性的α變體,然后在2021年1月底之前頻率迅速增加,成為主要變體。這種α變體后來被各種具有免疫逃逸特性的譜系所取代,導(dǎo)致病毒傳播水平的增加。Delta變體是其中最成功的,自2021年6月初以來一直占據(jù)主導(dǎo)地位(圖1A)。
Figure 1.(A)在倫敦污水處理廠收集的廢水樣本中鑒定的SARS-CoV-2變異的分?jǐn)?shù),基于對病毒RNA基因組中關(guān)鍵尖峰基因突變的定量。(B)廢水樣品中SARS-CoV-2 Δ亞變體AY.4.2與臨床樣品(黑線)的分?jǐn)?shù)相比,基于對病毒RNA基因組中Y145H尖峰基因突變的定量。顯示了每個采樣日期的重復(fù)序列的平均值 (n=12–20)。誤差線表示均值的標(biāo)準(zhǔn)誤差。數(shù)據(jù)來源:NIBSC內(nèi)部數(shù)據(jù)庫2021年10月。圖1B中提到的臨床數(shù)據(jù)來自英國HHSA關(guān)注的SARS-CoV-2變體和在英國正在研究的變體。技術(shù)簡報 26.衛(wèi)生和社會護(hù)理部,2021年。
最近的結(jié)果表明,NIBSC的科學(xué)家已經(jīng)能夠檢測到從7月初開始存在于污水中的最新Delta亞變體AY.4.2,然后穩(wěn)步增加并達(dá)到21個樣本中病毒序列的8%左右。
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